汇总：生物信息学常用数据库、硬件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是所称宾夕法尼亚州国立生质关键技术教育培训

EMBL []

欧洲分子生质学实验室室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是在世界上三大DNA 索引之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI索引共同均是由的国际DNA索引

CNGB []

华北地区国家索引（China National GeneBank）座落广州大鹏从新区，是继在世界上三大索引之后的在世界上第四大国家级索引。它是华北地区首个，也是唯一一个国家DNA库，相对于在世界上另外三个DNA库而言，国家DNA库样品保存的体量、存储量和可次访问的数据量皆是在世界上最大。

BIGD []

华北地区国家DNA组科学SAN 生命与健康大SAN (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

细胞器生质

LncRNAwiki [_Page]

人类文明长非大分子RNA索引

Rfam[]

十分相似Pfam的RNA家人和编者索引

Human protein atlas [ ]

人体肽在细胞核、其组织、病理条件下的暗示

Pfam []

Pfam是肽质家人和的索引，都有使用自生一个系统会框架生成的编者和多大分子分析。

SwissProt []

手动编者的非冗余肽大分子索引

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过拆分多个肽无关索引，包括了一个不便的对肽大分子同步进行功能编者的平台，都有对肽质家人和、结构设计域、功能亚基的数据分析

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过实验室测依此的结构设计

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最上半年

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

实验室验证的肽交互作用索引

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个功能强大的生物合成捷径拍照和编者应用软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选DNA的碱基和内含子等讯息画DNA结构设计

Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]

可离线赚取肽结构设计域的编者和左边讯息

ArrayExpress [ ]

数据来自EMBL的高通量功能DNA组学实验室的数据；

BAR []

在统计分析DNA功能时，一般来说会会参考DNA的暗示的系统，即DNA在动植质有所不同其组织有所不同发育时期的暗示丰度变化。通过离线统计分析网站BAR对候DNA同步进行暗示统计分析。 是一个动植质生信统计分析资源网站，用该网站统计分析DNA暗示时，不仅可以取得DNA暗示的系统的热图，还可以取得可视化的磁性电子显微镜图片，直观描绘出DNA在动植质其组织中都的暗示左边。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于DNA组编者文件画大分子DNA结构设计等功能

ProtParam []

肽特性统计分析是所称肽的一些质理和物理给定，如分子量、等电点、和氢原子均是由、消光乘积、放射性、不稳依此乘积、胆固醇人和所称数、水与性。这些给定，有效地同步进行肽的无关再生实验室。比如在粘液体系（大肠杆孢子、细孢子等）暗示和纯化旨在肽时，只能考虑肽的分子量、等电点、消光乘积、不稳依此乘积和水与性等。在复合物活命实验室中都，也只能根据这些给定优化实验室体系。

Protscale []

肽的亲神宗质主要由其侧碱基双键R，如果R只是H或是C、H两元素均是由的话，都是神宗水的，如果含有官能团侧碱基双键，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是官能团的（水与的）。神宗质有色氨酸、激素、苯丙氨酸、吲哚、乙酰、异乙酰、丙氨酸和甘氨酸（甘氨酸）。神宗质在肽质内外，在保持肽质的三级结构设计上，复合物和细胞内、抗体和抗原在在的交互作用等各种非共价键的分子混合方面，兼具不可忽视作用。

TMHMM []

肽的一环上皮细胞结构设计统计分析对于数据分析肽的亚细胞核依此位密切无关。如果兼具一环上皮细胞结构设计，肽很或许依此座落细胞核中都与上皮细胞无关的结构设计，如细胞核质上皮细胞、叶绿体上皮细胞或线粒体上皮细胞等内上皮细胞系统会。此外，肽一环上皮细胞结构设计统计分析对于肽功能统计分析也有一依此的帮助。比如某肽没有一环上皮细胞结构设计，但是亚细胞核依此位实验室辨识其可依此座落上皮细胞无关结构设计，这说明了该肽或许通过其他上皮细胞依此位肽动员过去的。

SignalP []

岩回波左边为回波肽切割点，岩之前的大分子为回波肽

回波肽是所称借助于从新衍海洋生物的肽质向黏液通路转移的短肽碱基，常会座落肽的N-末端，负责把肽质借助于到有所不同上皮细胞结构设计的亚细胞核器内。大分子黏液肽的mRNA在翻译时首先衍海洋生物N末端的回波肽，它被回波肽识别系统会肽(SRP)所识别系统会，SRP将核糖体携带至线粒体上，线粒体上皮细胞上的 SPR 受体识别系统会并与之混合。从新衍海洋生物肽在回波肽借助于下进发线粒体内腔，而回波肽则在回波半胱氨酸的作用下被切除。由于它的借助于，从新生的就能够通过线粒体上皮细胞进入腔内，最终被黏液到胞外。在宿主孢子中都暗示外源肽时，可用回波肽借助于外源肽依此位黏液到胞外，提升肽可溶性，在线粒体暗示系统会（大肠杆孢子、芽孢杆孢子等）和细胞器暗示系统会（如毕赤细孢子）中都均有运用于。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

肽质底物所称由肽质还原复合物乙烯的把 ATP 的磷酸基转移没错质肽质核苷酸（还原复合物、N-、色氨酸）上的步骤，或者在回波作用下混合 GTP（一般来说会以 GTP 取而代之 GDP），是生质体内一种普通的通气方式，在细胞核回波转导的步骤中都起不可忽视作用。在回波达到时通过取得一个或几个磷酸上市公司而被转录，而在回波增强时能去除这些上市公司，从而失去活命性。有时某个回波肽底物一般来说会导致中都游的肽依次愈演愈烈底物，形成底物级联反应会。

二、生质讯息学应用软件及下载碱基接：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE离线:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或